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Die Klassifizierung nach ICD-10 eignet sich gut, um Diagnosen grob zu erfassen und immer unter demselben Code zu finden. ICD ist in einer Art Kapitelstruktur aufgebaut, bei der die einzelnen Diagnosen hierarchisch angeordnet sind. Gleichzeitig bringt diese strikte Sortierung jedoch nicht ausreichend Flexibilität, um Zusammenhänge zu beschreiben. Nimmt man das Beispiel ‚Melanom‘, so findet sich dieses stets unter C43 (Bösartiges Melanom der Haut). Obwohl das Melanom gleichzeitig auch eine Hautkrankheit ist, kommt es bei L00-99 (Krankheiten der Haut und der Unterhaut) nicht vor.

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Damit sich niemand an ein völlig neues, komplexes System gewöhnen muss, soll SNOMED CT® für den Benutzer nicht direkt sichtbar werden, sondern nur im Hintergrund Verwendung finden. Die IT-Systeme können die SNOMED CT® Codes nutzen und darauf basierend dem Nutzer z.B. sinnvolle Filter- oder Suchfunktionen anbieten, die unabhängig von Synonymen oder Abkürzungen funktionieren.